Fitaovam-piadiana vaovao ho an'ny fitiliana ny tioberkilaozy sy ny famantarana ny fanoherana ny fanafody: Fandaharam-potoana mikendry ny taranaka vaovao (tNGS) ampiarahina amin'ny fianarana milina ho an'ny fitiliana ny fahatsapana tafahoatra ny tioberkilaozy
Tatitra momba ny literatiora: CCa: maodely diagnostika mifototra amin'ny tNGS sy ny fianarana milina, izay mety ho an'ny olona voan'ny tioberkilaozy tsy dia voan'ny bakteria loatra sy ny meningite vokatry ny tioberkilaozy.
Lohatenin'ny lahatsoratra: Fandaharam-potoanan'ny taranaka manaraka mikendry ny tioberkilaozy sy fianarana milina: paikady diagnostika tena saro-pady ho an'ny tubulaire pulmonary malemy sy ny meningite tubular.
Ara-potoana: 《Clinica Chimica Acta》
RAHA：6.5
Daty namoahana: Janoary 2024
Niaraka tamin'ny Akademia Siansa ao amin'ny Oniversiten'i Shina sy ny Hopitaly Beijing Chest ao amin'ny Oniversiten'ny Fitsaboana Capital, ny Macro & Micro-Test dia nametraka modely fitiliana tioberkilaozy mifototra amin'ny teknolojia vaovao momba ny filaharan'ny sela (tNGS) sy ny fomba fianarana milina, izay nanome fahatsapana avo lenta ho an'ny tioberkilaozy miaraka amin'ny bakteria vitsy sy ny meningitis tioberkilaozy, nanome fomba fitiliana vaovao momba ny hypersensitivity ho an'ny fitiliana klinika ny karazana tioberkilaozy roa, ary nanampy tamin'ny fitiliana marina, ny fitadiavana ny fanoherana ny fanafody ary ny fitsaboana ny tioberkilaozy. Mandritra izany fotoana izany, hita fa ny cfDNA plasma an'ny marary dia azo ampiasaina ho karazana santionany mety amin'ny fakana santionany klinika amin'ny fitiliana ny TBM.
Ato amin'ity fandalinana ity, santionan'ny plasma 227 sy santionan'ny tsiranoka cerebrospinal no nampiasaina mba hametrahana andiana klinika roa, izay nampiasana ny santionan'ny andiana diagnostika laboratoara mba hametrahana ny modely fianarana milina amin'ny diagnostika tioberkilaozy, ary ny santionan'ny andiana diagnostika klinika dia nampiasaina mba hanamarinana ny modely diagnostika napetraka. Ny santionany rehetra dia nokendrena voalohany tamin'ny alàlan'ny dobo probe fakana sary natao manokana ho an'ny Mycobacterium tuberculosis. Avy eo, mifototra amin'ny angon-drakitra momba ny filaharan'ny TB-tNGS, ny modely hazo fanapahan-kevitra dia ampiasaina hanaovana fanamarinana in-5 amin'ny andiana fiofanana sy fanamarinana ao amin'ny filaharana diagnostika laboratoara, ary azo ny tokonam-baravaran'ny diagnostika amin'ny santionan'ny plasma sy ny santionan'ny tsiranoka cerebrospinal. Ny tokonam-baravarankely azo dia ampidirina ao anaty andiana fitsapana roa amin'ny filaharana diagnostika klinika mba hahitana, ary ny fahombiazan'ny diagnostika an'ny mpianatra dia tombanana amin'ny alàlan'ny fiolahana ROC. Farany, azo ny modely diagnostika amin'ny tioberkilaozy.
Sary 1 kisarisary skematika amin'ny famolavolana fikarohana
Vokatra: Araka ny fetran'ny santionan'ny ADN CSF (AUC = 0.974) sy ny santionan'ny cfDNA plasma (AUC = 0.908) voafaritra ato amin'ity fandalinana ity, tamin'ireo santionany 227, ny fahatsapana ny santionan'ny CSF dia 97.01%, ny specificity dia 95.65%, ary ny fahatsapana sy ny specificity ny santionany plasma dia 82.61% sy 86.36%. Tao amin'ny fanadihadiana santionany 44 miaraka amin'ny cfDNA plasma sy ny ADN ranoka cerebrospinal avy amin'ny marary TBM, ny paikady diagnostika amin'ity fandalinana ity dia manana fitoviana avo lenta 90.91% (40/44) ao amin'ny cfDNA plasma sy ny ADN ranoka cerebrospinal, ary ny fahatsapana dia 95.45% (42/44). Amin'ny ankizy voan'ny tioberkilaozy pulmonary, ny paikady diagnostika amin'ity fandalinana ity dia mora tohina kokoa amin'ny santionany plasma noho ny valin'ny fitiliana Xpert amin'ny santionan'ny ranom-boankazo avy amin'ireo marary mitovy (28.57% VS 15.38%).
Sary 2. Fahombiazan'ny famakafakana ny modely fitiliana ny tioberkilaozy ho an'ny santionan'ny mponina
Sary 3. Vokatra diagnostika avy amin'ny santionany mifanambatra
Fehiny: Napetraka ato amin'ity fanadihadiana ity ny fomba fitiliana ny tioberkilaozy izay tena saro-pady, izay afaka manome fitaovana fitiliana manana fahatsapana avo indrindra ho an'ny marary voan'ny tioberkilaozy oligobacillary (kolontsaina ratsy). Ny fitiliana ny tioberkilaozy tena saro-pady mifototra amin'ny cfDNA plasma dia mety ho karazana santionany mety amin'ny fitiliana ny tioberkilaozy mavitrika sy ny meningite tioberkilaozy (mora kokoa ny manangona ny santionany plasma noho ny ranon-javatra cerebrospinal ho an'ny marary ahiahiana ho voan'ny tioberkilaozy ao amin'ny atidoha).
Rohy tany am-boalohany: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990? avy amin'ny%3Dihub
Fampidirana fohy ny vokatra fitiliana ny raboka Macro & Micro-Test
Noho ny fahasarotan'ny toe-javatra misy ny marary tioberkilaozy sy ny filàna isan-karazany, ny Macro & Micro-Test dia manome vahaolana NGS feno ho an'ny fanesorana ny santionan'ny rora, ny fananganana sy ny fandaminana ny tranomboky Qualcomm, ary ny famakafakana angon-drakitra. Ireo vokatra ireo dia mirakitra ny fitiliana haingana ny marary tioberkilaozy, ny fitadiavana ny tioberkilaozy tsy mahatohitra fanafody, ny karazana mycobacterium tioberkilaozy sy NTM, ny fitiliana ny tsy fahazakana ny tioberkilaozy tsy misy bakteria sy ny olona voan'ny tioberkilaozy, sns.
Kitapo fitiliana mitohy ho an'ny tioberkilaozy sy mycobacteria:
| Laharana Entana | anaran'ny vokatra | votoatin'ny fitsapana vokatra | karazana santionany | modely azo ampiharina |
| HWTS-3012 | Mpamoaka santionany | Ampiasaina amin'ny fitsaboana ny santionan'ny rora amin'ny alalan'ny ranoka, ary nahazo ny laharana voalohany amin'ny firaketana an-tsoratra, Sutong Machinery Equipment 20230047. | rora | |
| HWTS-NGS-P00021 | Kitapo famantarana habetsahana Qualcomm ho an'ny tioberkilaozy saro-pady (fomba fakana probe) | Fitiliana tsy misy fandidiana (biopsie ranoka) ny fahatsapana ho voan'ny tioberkilaozy pulmonary sy ny nodules ao amin'ny atidoha izay tsy misy bakteria; Nodinihina tamin'ny alalan'ny metagenomics ny santionan'ny olona ahiahiana ho voan'ny tioberkilaozy na mycobacteria tsy tioberkilaozy, ary nomena ny fampahalalana momba ny fahitana raha voan'ny tioberkilaozy na mycobacteria tsy tioberkilaozy ny olona, ary nomena ny fampahalalana fototra momba ny fanoherana ny fanafody amin'ny mycobacterium tioberkilaozy. | Ra periferika, ranon-javatra fanasan-damba alveolar, hydrothorax sy ascites, santionan'ny fanindronana mifantoka, ranon-javatra cerebrospinal. | Taranaka faharoa |
| HWTS-NGS-T001 | Kitapo famantarana ny Mycobacterium sy ny fanoherana ny fanafody (fomba fandaharana amplification multiplex) | Fitsapana karazana Mycobacterium, anisan'izany ny MTBC sy 187 NTM；Ny fitadiavana ny Mycobacterium tioberkilaozy ho mahatohitra fanafody dia mahafaoka fanafody 13 sy toerana fiovan'ny fototarazo 16. | Rora, ranon-javatra fanasan-damba alveolar, hydrothorax sy ascites, santionan'ny fitsipahana mifantoka, ranon-javatra cerebrospinal. | Sehatra roa sosona taranaka faharoa/fahatelo |
Zava-nisongadina: Kitapo famantarana ny Mycobacterium sy ny fanoherana ny fanafody HWTS-NGS-T001 (fomba fanamafisana maro samihafa)
Fampidirana vokatra
Ny vokatra dia mifototra amin'ireo fanafody andalana voalohany sy faharoa voalaza ao amin'ny torolàlana momba ny fitsaboana ny TB an'ny OMS, macrolides ary aminoglycosides izay matetika ampiasaina ao amin'ny torolàlana momba ny fitsaboana NTM, ary ireo toerana mahatohitra fanafody dia mandrakotra ny vondrona iray manontolo amin'ireo toerana mifandraika amin'ny fanoherana fanafody ao amin'ny katalaogin'ny fiovan'ny sahan'ny WHO Mycobacterium tuberculosis, ary koa ireo fototarazo mahatohitra fanafody sy toerana miova hafa voalaza araka ny fanadihadiana sy ny antontan'isa avy amin'ireo literatiora nahazo isa ambony ao an-toerana sy any ivelany.
Ny famantarana ny karazana NTM dia mifototra amin'ireo karazana NTM voafintina ao amin'ny torolàlana NTM navoakan'ny Chinese Journal of Tuberculosis and Respiratory Diseases sy ny marimaritra iraisana avy amin'ireo manam-pahaizana. Ireo "primer" natao ho an'ny karazana NTM dia afaka manamafy, mandamina ary manisy fanamarihana mihoatra ny 190.
Amin'ny alalan'ny teknolojia fanamafisana PCR multiplex kendrena, dia nohamafisina tamin'ny alalan'ny PCR multiplex ireo fototarazo mpandinika ny genotyping sy ireo fototarazo mahatohitra fanafody ao amin'ny Mycobacterium, ary azo ny fitambaran'ny amplicon an'ireo fototarazo kendrena ho hita. Azo amboarina ao amin'ny tranomboky fandaharana avo lenta taranaka faharoa na fahatelo ireo vokatra nohamafisina, ary azo ampiasaina amin'ny fandaharana lalina ny sehatra fandaharana rehetra taranaka faharoa sy fahatelo mba hahazoana ny fampahalalana momba ny fandaharana ireo fototarazo kendrena. Amin'ny fampitahana amin'ireo fiovan'ny fototarazo fantatra ao amin'ny tahiry referansa tafiditra ao anatiny (anisan'izany ny katalaogin'ny fiovan'ny complexe Mycobacterium tuberculosis an'ny WHO sy ny fifandraisany amin'ny fanoherana ny fanafody), dia voafaritra ireo fiovan'ny fototarazo mifandraika amin'ny fanoherana ny fanafody na ny faharefoan'ny fanafody miady amin'ny tioberkilaozy. Miaraka amin'ny vahaolana fitsaboana santionan'ny sputum misokatra ho azy an'ny Macro & Micro-Test, dia voavaha ny olan'ny fahombiazan'ny fanamafisana asidra nokleika ambany amin'ny santionan'ny sputum klinika (avo folo heny noho ny fomba nentim-paharazana), mba hahafahana mampihatra mivantana amin'ny santionan'ny sputum klinika ny famantarana ny fanoherana ny fanafody.
Karazana famantarana vokatra
34ireo fototarazo mifandraika amin'ny fanoherana ny fanafody18fanafody miady amin'ny tioberkilaozy sy6Hita ny fanafody NTM, izay mandrakotra297toerana mahatohitra fanafody; Karazana Mycobacterium tioberkilaozy folo ary mihoatra ny190karazana NTM no hita.
Tabilao 1: Fampahalalana momba ny fanafody 18+6 +190+NTM
Tombony azo avy amin'ny vokatra
Fahaiza-miovaova ara-pitsaboana matanjaka: azo tsikaritra mivantana amin'ny alàlan'ny akora afaka mandevona ho azy ny santionan'ny rora tsy mila kolontsaina.
Tsotra ny fomba fanandramana: tsotra ny dingana voalohany amin'ny fampiasana fanamafisana, ary vita ao anatin'ny 3 ora ny fananganana tranomboky, izay manatsara ny fahombiazan'ny asa.
Fanoherana feno ny fanoratana sy ny fanafody: mandrakotra ny toerana misy ny fanoherana ny fanoratana sy ny fanafody ao amin'ny MTB sy NTM, izay teboka fototra ifantohana ara-pitsaboana, ny famantarana marina ny fanoherana ny fanoratana sy ny fanafody, ny fanohanana ny rindrambaiko famakafakana mahaleo tena, ary ny famoronana tatitra famakafakana amin'ny tsindry iray monja.
Fifanarahana: fifanarahana amin'ny vokatra, mifanaraka amin'ny sehatra ILM sy MGI/ONT mahazatra.
Famaritana ny vokatra
| Kaody vokatra | anaran'ny vokatra | Sehatra famantarana | fepetra arahana |
| HWTS-NGS-T001 | Kitapo famantarana ny Mycobacterium sy ny fanoherana ny fanafody (fomba fanamafisana maro samihafa) | ONT, Illumina, MGI, Salus pro | 16/96rxn |
Fotoana fandefasana: 23 Janoary 2024