Fianarana vao haingana navoaka tao amin'nyMikrobiômaNanao fanadihadiana metagenomika viriosy tamin'ny biby mampinono kely miisa 846 — anisan'izany ny ramanavy, ny biby mpikiky, ary ny shrew — nangonina tao Sierra Leone, Afrika Andrefana. Nahita viriosy RNA mifandraika amin'ny biby mampinono miisa 39 ny fanadihadiana, izay ahitana viriosy vaovao miisa 26 sy viriosy efa fantatra teo aloha miisa 13. Anisan'ireo, ny fianakaviana Paramyxoviridae no naneho ny fahasamihafana betsaka indrindra, raha ny biby mpikiky kosa no nanana karazana viriosy betsaka indrindra (n = 26).
Ny fanombanana ny mety ho fisian'ny aretina zoonotika dia naneho viriosy zoonotika telo fantatra—ny viriosy encephalomyocarditis, ny viriosy Lassa, ary ny Rocahepevirus sp.—ary koa viriosy telo mety hiparitaka: ny viriosy Melian, ny viriosy hepatita amin'ny biby mpikiky, ary ny Hunnivirus A. Tsara homarihina fa anisan'ireo viriosy vao fantatra, ny Bat ledantevirus 2 no naneho ny fifandraisana phylogenetic akaiky indrindra amin'ny viriosy Le Dantec izay mamindra amin'ny olombelona. Ny fanadihadiana serolojika dia nahitana ihany koa ireo antikôra neutralizing manohitra ity viriosy ity tamin'ny 2.8%-n'ny mponina teo an-toerana, izay manondro fa efa nifandray tamin'ny olombelona teo aloha, izay mety tsy hita mihitsy.
Ireo zavatra hita ireo dia manasongadina ny fisian'ny tahiry viriosy betsaka izay anjakan'ny biby mpikiky any Afrika Andrefana ary manamafy ny maha-zava-dehibe ny paikady fanaraha-maso mitambatra eo amin'ny fifandraisan'ny olombelona sy ny biby. Ny fampifangaroana ny fitiliana metagenomika amin'ny fanamarinana serolojika dia manome rafitra matanjaka hamantarana ireo viriosy manana fahafahana miteraka aretina zoonotika sy miparitaka.
Tao anatin'ny folo taona lasa, maherin'ny 60% amin'ireo aretina mifindra vao misondrotra amin'ny olombelona no avy amin'ny biby fiompy, ary ny ramanavy, ny voalavo ary ny bibilava dia fantatra fa mpampiantrano lehibe ny viriosy zoonotic. Afrika dia heverina ho toerana mafana indrindra amin'ny aretina zoonotic. Ohatra, Sierra Leone dia nitatitra tranga maherin'ny 28.000 nandritra ny fihanaky ny Ebola tamin'ny taona 2014–2016.
Na dia eo aza ny enta-mavesatry ny aretina zoonotika eto amin'ity faritra ity, dia mbola tsy voafaritra tsara ny fahasamihafana sy ny fiparitahan'ny viriosy amin'ny biby mampinono kely any an'ala. Mba handaminana io banga io, dia nanao fanadihadiana virome mirindra tamin'ny biby mampinono kely 846 nosamborina tany amin'ny toerana telo tao Sierra Leone teo anelanelan'ny taona 2018 sy 2023 ireo mpikaroka. Ny tanjon'ny fanadihadiana dia ny hamantatra ny fahasamihafan'ny viriosy, hamantatra ireo kandidà manana fahafahana mamindra amin'ny karazana hafa, hanombana ny mety hisian'ny zoonotika, ary hamorona porofo hanohanana ny rafitra fampitandremana mialoha momba ny aretina mifindra vao misondrotra.
Fomba fototra
Nampiasa fomba fiasa feno momba ny metagenomics viraliny ny fanadihadiana:
- Fanodinana santionany:Nangonina ny sela tao amin'ny fo, aty, saliva, havokavoka ary voa, natambatra, natao mitovy lenta, ary noesorina tamin'ny ARN manontolo.
- Filaharana sy fanangonana:Natao talohan'ny fananganana ny tranomboky ny fampihenana ny ARN ribosomal, narahin'ny fandaharana avo lenta tamin'ny fampiasana ny sehatra Illumina NovaSeq 6000. Namboarina de novo ireo viriosy mifamatotra aminy.
- Famantarana ny viriosy:Ny viriosy dia fantatra mifototra amin'ny fampifanarahana ny fototarazo RNA polymerase (RdRp) miankina amin'ny RNA. Ny viriosy mifandray amin'ny biby manana hazon-damosina ihany no voatazona, ankoatra ny viriosy bakteria, holatra ary zavamaniry.
- Famakafakana ny bioinformatika:Natao ny fanarenana filôzenetika, ny famakafakana ny fitambarana, ny modely tambajotran'ny fifindran'ny karazana samihafa, ary ny fanombanana ny mety ho fisian'ny aretina zoonotika.
- Fanamarinana serolojika:Nisy fanadihadiana momba ny fanafoanana ny pseudovirus mifototra amin'ny VSV novolavolaina ho an'ny Bat ledantevirus 2. Hita tao amin'ny 2.8%-n'ny seran'olombelona ny antikôra mpanafoana, izay manome porofo fa mety ho azo afindra amin'ny alalan'ny zoonotika.
FIANARANAVOKATRA
1. Fahitana sy Fahasamihafana amin'ny Viral
Ity fandalinana ity dia nanao fanadihadiana momba ny filaharan'ny sela amin'ny alalan'ny transcriptomic tamin'ny bibidia 846 nangonina tao Sierra Leone, anisan'izany ny biby mpikiky, ny ramanavy ary ny shrews. Mifototra amin'ny filaharan'ny fototarazo RNA polymerase (RdRp) miankina amin'ny RNA, dia viriosy RNA mifandraika amin'ny biby mampinono miisa 39 no hita, izay ahitana viriosy 13 efa fantatra teo aloha sy viriosy vaovao 26.
Raha ny firafitry ny viriosy no jerena, ny fianakaviana Paramyxoviridae no naneho ny ambaratongan'ny fahasamihafana avo indrindra tamin'ireo karazana viriosy telo ireo, arahin'ny Astroviridae sy Picornaviridae. Raha ny momba ny fizarazarana ny viriosy, ny biby mpikiky no nandray anjara tamin'ny fahasamihafana lehibe indrindra tamin'ny viriosy, izay nitazona karazana viriosy 26, izay manondro ny anjara asany lehibe amin'ny maha-mpitehirizana ny fahasamihafana misy eo amin'ny viriosy ao amin'ny faritra.
2. Loza ateraky ny Zoonotika
Ny fanombanana ny mety ho fisian'ny viriosy zoonotika dia namantatra viriosy zoonotika telo fantatra: ny viriosy encephalomyocarditis, ny viriosy Lassa, ary ny karazana Rocahepevirus. Ankoatra izany, viriosy telo—viriosy Melian, viriosy hepatita biby mpikiky, ary ny Hunnivirus A—no voafaritra fa mety hiparitaka amin'ny hafa.
Amin'ireo viriosy 26 vao hita, efatra no vinavinaina fa hanana hery zoonotika avo lenta mifototra amin'ny toetran'ny filôzenetika sy ny génomika. Tsara homarihina fa ny Bat ledantevirus 2 no naneho ny fifandraisana filôzenetika akaiky indrindra amin'ny viriosy Le Dantec fantatra fa mamindra aretina amin'ny olombelona.
Nanamafy izany ny fanadihadiana serolojika nanaraka, satria hita tamin'ny 2.8%-n'ny sera avy amin'ny mponina teo an-toerana ny antikôra mpanafoana ny Bat ledantevirus 2. Ity valiny ity dia manondro fa mety efa nisy aretina tsy fantatra na tsy misy soritr'aretina teo amin'ny mponina, izay manasongadina ny mety ho lalan'ny fifindran'ny aretina zoonotic saingy tsy hita teo aloha.
3. Dinamika Fampitana Karazana Iraisana
Ny fanadihadiana momba ny fifindran'ny aretina eo amin'ny karazana samihafa dia naneho fa ny biby mpikiky dia mitana toerana afovoany ao amin'ny tambajotra fizarana viriosy, miasa ho toy ny teboka fototra izay manamora ny fifanakalozana viriosy eo amin'ny karazana mpampiantrano. Viriosy miisa 15 no hita fa mety hifindra amin'ny karazana samihafa.
Ny fanadihadiana fanampiny momba ny lamina fifindran'ny viriosy miampita filaharana dia naneho fa ny fizarana viriosy dia mitranga matetika kokoa eo amin'ireo mpampiantrano ao anatin'ny filaharana taksonomika mitovy, izay manondro fa ny fifandraisan'ny mpampiantrano dia mitana anjara toerana lehibe amin'ny dinamikan'ny fifindran'ny viriosy. Mifanohitra amin'izany kosa, ny ramanavy dia naneho fahafaha-mifindra amin'ny filaharana miampita filaharana ambany kokoa.
Zava-dehibe ny nahitana porofo momba ny fanitarana ny faritra misy ny biby mpampiantrano tamin'ny viriosy sasany. Ohatra, ny viriosy Melian, izay noheverina ho an'ny shrews teo aloha, dia hita ihany koa tamin'ny biby mpikiky tamin'ity fandalinana ity, izay manondro ny mety ho fiovan'ny fahaizan'ny biby mpampiantrano mifanaraka amin'ny toe-javatra sy ny fitomboan'ny mety hisian'ny fifindrana mivelatra kokoa.
Fehin-kevitra sy fiantraikany amin'ny fahasalamam-bahoaka
- Fahasamihafan'ny virome avo lenta amin'ny biby mampinono kely any an'ala:Ny nahitana viriosy ARN 39, anisan'izany ny karazany vaovao 26, dia mampiharihary tahiry viriosy lehibe ao amin'ny faritra ary mitatitra voalohany fa misy viriosy vaovao manana hery fiarovana avo lenta (ohatra, Bat ledantevirus 2).
- Biby mpikiky ho lasibatra laharam-pahamehana amin'ny fanaraha-maso:Ny biby mpikiky no ivon'ny fifindran'ny viriosy ary mitondra ny fahasamihafan'ny viriosy betsaka indrindra, izay maneho ny mety ho fiparitahana lehibe indrindra.
- Ilaina ny paikady fanaraha-maso mitambatra:Ireo zavatra hita dia manohana ny fanomezana laharam-pahamehana ny biby mpikiky amin'ny fandaharan'asa fanaraha-maso mavitrika sy ny fampiharana fomba fiasa mitambatra izay mampifangaro ny metagenomika, ny serolojia ary ny fanaraha-maso ara-tontolo iainana eo amin'ny fifandraisan'ny olombelona sy ny bibidia.
Amin'ny ankapobeny, ity fanadihadiana ity dia manome porofo tena ilaina hanohanana ny rafitra fampitandremana mialoha sy ny rafitra fanombanana ny mety ho fisian'ny aretina zoonotika vao misondrotra, izay manamafy ny maha-zava-dehibe ny fanaraha-maso mialoha any amin'ny faritra mampidi-doza.
Fampahalalana momba ny vokatra
Fotoana fandefasana: 23 Martsa 2026